贷款担保公司收取担保费合法。依据《中小企业融资担保机构风险管理暂行办法》，担保费率与风险成本挂钩，合法且合理。不及时处理可能导致费率不透明，引发纠纷。
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贷款担保公司收取担保费，处理方式包括按规定费率执行或双方协商。应选择符合法规的费率，并确保合同透明，避免高额额外费用。
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担保费合法。操作：1. 明确担保费率，按银行利率50%为基准；2. 根据风险调整费率，上下浮动30%-50%；3. 特殊情况可与监管部门协商，确保费率合理透明。